Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrrc58Q3UGP9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc58Q3UGP9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms