Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil3Q3UFQ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms