Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip13Q3UA06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms