Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U595 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U595 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U595 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U595 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U595 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U595 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U595 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U595 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U595 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms