Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms