Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
InipQ3TXT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
InipQ3TXT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
InipQ3TXT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
InipQ3TXT3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms