Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt1Q3TX08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt1Q3TX08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms