Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms