Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pnpla6Q3TRM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms