Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calr4Q3TQS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calr4Q3TQS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Calr4Q3TQS0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Calr4Q3TQS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Calr4Q3TQS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms