Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms