Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4cQ3TKR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms