Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l3Q3TBL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms