Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa26Q3L180 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa26Q3L180 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms