Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riiad1Q3KNY5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riiad1Q3KNY5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms