Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
V1rd19Q3KNP5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms