Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpusd2Q149F1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpusd2Q149F1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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