Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b3Q0VF55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b3Q0VF55 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms