Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms