Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam83bQ0VBM2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam83bQ0VBM2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83bQ0VBM2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms