Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TrioQ0KL02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms