Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700061G19RikQ08EE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms