Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q08AU9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q08AU9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q08AU9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q08AU9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q08AU9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q08AU9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q08AU9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q08AU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q08AU9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q08AU9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q08AU9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q08AU9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q08AU9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q08AU9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q08AU9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q08AU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q08AU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms