Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms