Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou6f1Q07916 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou6f1Q07916 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms