Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms