Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apoc2Q05020 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms