Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CkbQ04447 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CkbQ04447 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CkbQ04447 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CkbQ04447 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CkbQ04447 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CkbQ04447 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CkbQ04447 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CkbQ04447 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CkbQ04447 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CkbQ04447 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CkbQ04447 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms