Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mmp11Q02853 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mmp11Q02853 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms