Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd1Q02242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms