Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd1Q01822 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd1Q01822 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms