Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cacna1cQ01815 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cacna1cQ01815 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms