Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a2Q01149 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms