Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp1Q00915 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms