Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx2Q00262 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx2Q00262 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms