Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shc1P98083 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc1P98083 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms