Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lama4P97927 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama4P97927 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama4P97927 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lama4P97927 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama4P97927 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lama4P97927 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama4P97927 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms