Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig3P97386 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig3P97386 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig3P97386 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms