Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp2P97299 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms