Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ElocP83940 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ElocP83940 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ElocP83940 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ElocP83940 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ElocP83940 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ElocP83940 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ElocP83940 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ElocP83940 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ElocP83940 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ElocP83940 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ElocP83940 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ElocP83940 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms