Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf3P70671 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf3P70671 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf3P70671 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf3P70671 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf3P70671 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms