Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tp53bp1P70399 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53bp1P70399 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms