Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf6P70279 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf6P70279 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Surf6P70279 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms