Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmgb1P63158 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgb1P63158 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb1P63158 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms