Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb2P63137 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrb2P63137 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms