Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrb3P63080 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrb3P63080 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms