Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx1P63013 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx1P63013 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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