Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps27aP62983 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms