Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f4P62515 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f4P62515 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f4P62515 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms