Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm5P62322 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms